Среди трудностей, с которыми сталкиваюсь я, как учитель при организации научно-исследовательской деятельности учащихся можно выделить  следующие:

• слабое владение методологией научного исследования, недостаток методической, научной, психолого-педагогической, специальной литературы
• большая загруженность учащихся, отсутствие времени ;
• преобладание в традиционном обучении репродуктивных методов, вступающих в противоречие с исследовательскими методами .

Причины, препятствующие научному творчеству в образовательном процессе:

• боязнь вовлечь детей в «несвойственную им научную деятельность»;
• наукообразие в образовательном процессе, т.е. оторванное от жизни, схоластическое знание.

А у Вас, Юлия, какие возникают затруднения? Если можно поделитесь.